Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Top2bQ64511 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Top2bQ64511 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms