Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PtprdQ64487 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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PtprdQ64487 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprdQ64487 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PtprdQ64487 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprdQ64487 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms