Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tbr1Q64336 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbr1Q64336 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbr1Q64336 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbr1Q64336 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbr1Q64336 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms