Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms