Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ly6eQ64253 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6eQ64253 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms