Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms