Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f3Q63955 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms