Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zic2Q62520 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms