Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf260Q62513 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Znf260Q62513 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms