Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim28Q62318 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim28Q62318 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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