Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SypQ62277 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms