Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sox16Q62247 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms