Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SnrpcQ62241 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms