Protein–RNA interactions for Protein: Q62193

Rpa2, Replication protein A 32 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa2Q62193 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpa2Q62193 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpa2Q62193 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms