Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ttf1Q62187 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttf1Q62187 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttf1Q62187 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms