Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema3bQ62177 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms