Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms