Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn1Q61809 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms