Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms