Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HlxQ61670 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HlxQ61670 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HlxQ61670 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms