Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1aQ61495 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms