Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms