Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacna1eQ61290 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1eQ61290 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms