Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms