Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot7Q60809 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Cnot7Q60809 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Cnot7Q60809 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Cnot7Q60809 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot7Q60809 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Cnot7Q60809 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms