Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mkrn3Q60764 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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Mkrn3Q60764 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mkrn3Q60764 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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