Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms