Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr1d2Q60674 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms