Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprnQ60673 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprnQ60673 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprnQ60673 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprnQ60673 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprnQ60673 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprnQ60673 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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