Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2f1Q60632 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2f1Q60632 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms