Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Thoc6Q5U4D9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Thoc6Q5U4D9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms