Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gprasp1Q5U4C1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gprasp1Q5U4C1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms