Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc125Q5U465 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc125Q5U465 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms