Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc42Q5SV66 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc42Q5SV66 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms