Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd40Q5SUE8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd40Q5SUE8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms