Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TefmQ5SSK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms