Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav8d-2Q5R1B6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms