Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms