Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trappc1Q5NCF2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc1Q5NCF2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc1Q5NCF2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms