Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttf2Q5NC05 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms