Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SynaQ5G5D5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SynaQ5G5D5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms