Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm3558Q5FWC9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3558Q5FWC9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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