Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU57

Spata13, Spermatogenesis-associated protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata13Q5DU57 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spata13Q5DU57 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Spata13Q5DU57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spata13Q5DU57 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms