Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1lQ5D525 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syce1lQ5D525 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms