Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Adamts18Q4VC17 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Adamts18Q4VC17 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms