Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srek1ip1Q4V9W2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms