Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trp53i11Q4QQM4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trp53i11Q4QQM4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms