Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp3Q499E0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp3Q499E0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms