Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx25Q3ZT31 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms