Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mtmr11Q3V1L6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mtmr11Q3V1L6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms